Наравне с коммерческими предприятиями, организации с бюджетным финансированием используют автоматизированный учет бухгалтерских операций. Программа 1С для бюджетных учреждений имеет некоторые отличия, отвечающие потребностям органов государственной власти, властей местного самоуправления, органам казначейства. Для разных типов государственных учреждений, это организации казначейского, бюджетного и автономного типа в программе «1С:Бухгалтерия государственного учреждения 8» обеспечена сопоставимость данных. Таким образом, 1С для бюджетных учреждений унаследовала возможность ведения учета деятельности как в рамках одного государственного предприятия, так и в пределах целой группы компаний, причем, деятельность организаций может кардинально отличаться друг от друга. Структурные подразделения могут служить для реализации разных целей, при этом находясь в единой информационной базе, средствами которой проводится централизованный учет.