В общем надо решить проблемы:
1. с свн комитами и корректным свн апом в папки доменов (возможно права) + правильно структурой после svn Up (скрин
clip2net.com/s/5n9Wgl )
2. с автоподнятием апача (он не поднимается после ребута, поэтому не работает phpmyadmin)
3. Настроить полный бэкап сайта на час ночи ежедневно, с архивом в 30 дней (после 30 дней удаляется самый старый)
4. В phpmyadmin запретить юзеру видеть все базы (сейчас не корректно работает, хотя настройка стоит)
5. Разобратся почему созданные домены ссылаются на корневую директорию главного