Ведомственные письма имеют определенный риск в виде спора с проверяющими органами ИФНС. Чтобы понять, какие из писем будут приняты инспекторами во внимание, а какие проигнорированы, нужно понимать порядок рассмотрения позиций, сформулированный в письме.
Значение имеет орган, от которого исходит изъяснение. Если письмо от ФНС согласовано с Минфином, тогда его изложение лучше принимать к действию, иначе могут возникнуть проблемы с налоговиками.
Также источник разъяснения может быть указан в сопроводительных формулировках.
http://www.jur-online.ru/index.php?page=149&news=381